中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥物研究所外景。(資料圖片)
用時10年、耗資10億美元,是新藥研發(fā)領(lǐng)域公認的“雙十定律”。隨著新技術(shù)不斷涌現(xiàn),生物醫(yī)藥企業(yè)不斷借力人工智能的新質(zhì)力量,嘗試打破這一“定律”。如今,有“中國藥谷”之稱的北京中關(guān)村科技園區(qū)大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地,正在打造“人工智能+”的醫(yī)藥創(chuàng)新生態(tài),通過提高成功率、精準度,加速新藥研發(fā)進程,助力生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)邁向高端。
靶向精準
新藥研發(fā)難在哪里?以癌癥為例,如果將腫瘤比喻成一把鎖,靶點是鎖眼,藥就是鑰匙。為了找到匹配度最高的鑰匙,生物醫(yī)藥企業(yè)需要耗費大量人力財力去篩選、優(yōu)化。人工智能與生俱來的“快反饋”,讓生物醫(yī)藥企業(yè)發(fā)現(xiàn)了研發(fā)加速的可能性。在大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地,不少企業(yè)、科研院所正運用這項新技術(shù)尋找“鎖眼”,打造“鑰匙”。
分子結(jié)構(gòu)包括功能性分子是新藥發(fā)現(xiàn)最源頭的路徑。在中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥物研究所,科研人員最擅長在天然產(chǎn)物中發(fā)現(xiàn)新藥。他們借助核磁共振,利用計算機視覺技術(shù)即可解析藥物復(fù)雜分子結(jié)構(gòu)。將解析出的碳譜數(shù)字輸入人工智能解譜系統(tǒng),短短5秒鐘之后,就能生成多個分子結(jié)構(gòu)式。
中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥物研究所研究員、博士生導(dǎo)師汪小澗是解譜系統(tǒng)的研發(fā)帶頭人。他告訴記者,研發(fā)新藥費時費力,將碳譜轉(zhuǎn)化成結(jié)構(gòu)式是研發(fā)新藥的關(guān)鍵一步。以前專業(yè)人員需要3天到5天完成的工作,現(xiàn)在被智能識譜、智能搜譜、智能解譜技術(shù)壓縮至短短幾秒,效率的提升不言而喻。
同在該藥物研究所,新藥開發(fā)研究室副研究員夏杰則開發(fā)出一個小分子抗菌藥物AI自動設(shè)計軟件。以前,研發(fā)人員需要掌握盡可能多的數(shù)據(jù),耗時幾個月才能完成的設(shè)計,如今,憑借AI技術(shù)的快反饋,這套軟件不需人為干預(yù),只要提供靶點、靶標和相應(yīng)數(shù)據(jù),2小時就能設(shè)計出一些簡單的分子。
不管是核磁5秒鐘“識圖”,還是軟件設(shè)計的“2小時達”,都是在研發(fā)進程不變的前提下,實現(xiàn)既有的環(huán)節(jié)更有效率。人工智能在提高準確率上也大有可為。以前要找到一個具有成藥潛力的分子,研究人員往往需要在前期合成的將近1000個分子中進行篩選;有了人工智能助力,篩選范圍可以從近千個銳減至20個至40個分子,產(chǎn)出也是驚人的。
“現(xiàn)階段,人工智能還僅僅是一種輔助工具?!蓖粜菊f,借助生成式人工智能的分子設(shè)計方法,他們已發(fā)現(xiàn)若干具有治療自身免疫性疾病以及顯著抗腫瘤活性的臨床候選物,正在進一步的臨床前研究過程中。他希望能通過合作實現(xiàn)臨床數(shù)據(jù)庫的擴容,提高精準度,“如果我們合成的20個分子中,有2個到3個到達臨床階段甚至成為新藥,那將是人工智能巨大的成功”。
最佳路徑
作為北京醫(yī)藥健康產(chǎn)業(yè)發(fā)展的主陣地,大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地積極引進人工智能、大數(shù)據(jù)與醫(yī)藥健康交叉融合項目,持續(xù)推動生命健康產(chǎn)業(yè)前沿技術(shù)在園區(qū)落地生根。
不久前,生物醫(yī)藥基地新添AI智能新藥研發(fā)平臺——“X-Gen AI新藥發(fā)現(xiàn)與設(shè)計研究中心”,該平臺由園區(qū)內(nèi)企業(yè)熱景生物成立,推動AI技術(shù)在藥物靶點發(fā)現(xiàn)、藥效篩選、藥物分子設(shè)計和優(yōu)化、臨床試驗設(shè)計和管理、藥物重定位等重點環(huán)節(jié)的應(yīng)用。熱景生物旗下兩家高新藥企——舜景醫(yī)藥與堯景基因,在AI技術(shù)助力下加速研發(fā)進程,提高研發(fā)和臨床的成功率。
研究中心負責(zé)人許立達告訴記者,做創(chuàng)新藥,新靶點的研究是關(guān)鍵,利用人工智能技術(shù)對海量多組學(xué)數(shù)據(jù)進行挖掘可以幫助他們發(fā)現(xiàn)治療疾病的全新作用機制。針對發(fā)現(xiàn)的新靶點,“根據(jù)‘鎖眼’的形狀,用人工智能或生物計算的方法,描摹出‘鑰匙’的樣子,就是從頭設(shè)計;有了‘鑰匙’雛形‘半成品’,再不斷迭代優(yōu)化,讓‘鑰匙’更精準匹配‘鎖眼’,這就是‘親和力成熟’”。許立達說,“這兩條路徑相輔相成,可以幫助我們更快找到最合適的‘鑰匙’。”
在抗體分子優(yōu)化方面,他們已經(jīng)搭建了一條計算輔助抗體親和力成熟的路線,能夠有效預(yù)測關(guān)鍵氨基酸,并利用這些預(yù)測結(jié)果指導(dǎo)抗體的定向突變,讓他們在2個月內(nèi)得到親和力提升10倍的抗體。在AI加持下,核酸藥開發(fā)效率更高,8小時即可完成核酸序列的設(shè)計和篩選。目前,舜景醫(yī)藥借力AI研發(fā)的首款適應(yīng)癥為心腦血管疾病的創(chuàng)新藥已經(jīng)走過研發(fā)階段,即將進入臨床。
值得一提的是,發(fā)現(xiàn)與設(shè)計這個新藥的研究中心有干濕兩類實驗室。濕實驗指傳統(tǒng)的生物實驗室,有各種試劑、實驗操作;干實驗指利用計算機的無水化操作。計算機結(jié)果在濕實驗中反復(fù)驗證后,在計算機上進一步優(yōu)化迭代,形成人工智能進入生物制藥研發(fā)的成功路徑。
人工智能研發(fā)新藥屬于交叉學(xué)科,需要具備信息科學(xué)、制藥工程、生物技術(shù)等專業(yè)背景的研發(fā)人員?!拔覀?年前已經(jīng)認識到AI技術(shù)是非常重要的加速器,開始組建隊伍,一邊做研發(fā),一邊打磨算法、模型、流程?,F(xiàn)在嘗到了AI提高成功率的甜頭?!痹跓峋吧锒麻L林長青眼中,AI技術(shù)已經(jīng)成為很多行業(yè)實現(xiàn)加速發(fā)展的最佳“助攻”。
夯實基礎(chǔ)
在生物醫(yī)藥行業(yè),人工智能改變的不只是創(chuàng)新藥研發(fā)進程,更深刻影響著醫(yī)療器械的發(fā)展。中關(guān)村科技園區(qū)大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地公司黨委副書記、總經(jīng)理申海成告訴記者,基地已有上市產(chǎn)品600余個,其中一類新藥4個,國家創(chuàng)新醫(yī)療器械15個。在醫(yī)療機器人研發(fā)領(lǐng)域,人工智能也在大展拳腳。
創(chuàng)傷小、疼痛輕、恢復(fù)快,是手術(shù)患者共同的愿望,在神經(jīng)外科表現(xiàn)得尤為突出。有些患者的病灶位于顱內(nèi)深部,以往手術(shù)時需在患者顱骨上打4顆到5顆釘子固定框架,且術(shù)中操作調(diào)整角度和入路存在一定限制。對醫(yī)生而言,就像要求不切開“西瓜”,取出一粒特定的“西瓜籽”,難度之大可想而知。
區(qū)內(nèi)企業(yè)華科精準(北京)醫(yī)療設(shè)備股份有限公司將機器人技術(shù)、人工智能、影像處理技術(shù)融合,形成了神外手術(shù)機器人、磁共振引導(dǎo)激光消融治療系統(tǒng)、手術(shù)計劃軟件等多款國家藥品監(jiān)督管理局批準創(chuàng)新醫(yī)療器械產(chǎn)品。公司聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席技術(shù)官劉文博介紹,他們既有面向基層醫(yī)院神經(jīng)外科微型導(dǎo)航定位機器人,用于急診腦出血快速精準診療,幫醫(yī)生做手術(shù)規(guī)劃、路徑設(shè)計,以及術(shù)中精準穿刺;也有面向更復(fù)雜、高風(fēng)險的顱內(nèi)手術(shù)形成全鏈條的微創(chuàng)精準手術(shù)方案,實現(xiàn)精準定位電極植入、微創(chuàng)治療、激光消融全流程賦能。
這些神經(jīng)外科手術(shù)機器人可以減輕患者的痛苦,也可減輕醫(yī)生壓力,讓手術(shù)更精準、高效和智能。手術(shù)機器人自帶“導(dǎo)航系統(tǒng)和大腦地圖”——手術(shù)計劃軟件一鍵智能融合多模態(tài)影像,實現(xiàn)血管、腫瘤等組織三維重建;3D結(jié)構(gòu)光可在1分鐘內(nèi)掃描患者面部上百萬個點云,將腦部真實信息與影像信息高精度配準,提供最便捷、最安全的手術(shù)路徑和術(shù)中手術(shù)引導(dǎo)?!拔鞴献选痹谀睦?、怎樣取出“西瓜籽”,一目了然。
要讓人工智能在醫(yī)藥健康領(lǐng)域發(fā)揮更大的作用,大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地管委會也花了不少心思。申海成說,大興生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)基地正在儲備和整合醫(yī)藥健康數(shù)據(jù)資源。引進北京市醫(yī)療器械大數(shù)據(jù)研究中心,并計劃建立“醫(yī)療器械大數(shù)據(jù)共享云中心”和“醫(yī)療器械A(chǔ)I超算服務(wù)中心”,加快醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)集群的數(shù)字化進程。同時,建設(shè)北京生物信息智算中心,促進生物樣本數(shù)據(jù)、臨床數(shù)據(jù)和研究數(shù)據(jù)開放共享,并提供豐富的計算醫(yī)學(xué)應(yīng)用場景。
“數(shù)據(jù)是推進AI技術(shù)在醫(yī)藥健康領(lǐng)域加快應(yīng)用的核心驅(qū)動力?!痹S立達說,“我們吸收借鑒前沿技術(shù)建立自己的算法流程,再依托公共數(shù)據(jù)庫和企業(yè)內(nèi)部數(shù)據(jù)對模型進行訓(xùn)練,讓它變得更‘聰明’。” (經(jīng)濟日報記者 楊學(xué)聰)
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